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真核細(xì)胞rna提取的實(shí)驗(yàn)報(bào)告范文
篇一:真核細(xì)胞RNA的提取
一.原理
本方法利用鹽酸胍抑制RNA酶,勻漿裂解細(xì)胞,采用有機(jī)溶劑抽提去除蛋白質(zhì)。通過選擇性沉淀RNA分子去除DNA。
二.方法
1.樣品處理
、沤M織樣品處理:取新鮮的組織樣品稱重后,剪碎成約1cm2的組織塊直接加入勻漿液中進(jìn)行RNA提取,或液氮中速凍-70℃保存。
⑵貼壁培養(yǎng)細(xì)胞處理:用PBS洗細(xì)胞一次,吸干溶液后將培養(yǎng)板快速移至液氮中冷凍后轉(zhuǎn)到-70℃保存;或加入1ml勻漿至培養(yǎng)板中直接裂解細(xì)胞,然后將粘稠的裂解液進(jìn)一步勻漿。
、菓腋∨囵B(yǎng)細(xì)胞處理:離心收集細(xì)胞,用PHS懸浮漂洗再田心收集,若不立即提取RNA,則可經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)至一70℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
2.加l()倍體積鹽酸胍勻漿液[至準(zhǔn)備好的樣品細(xì)胞中,高速勻漿1min。
3.勻漿液5000g,室溫離心10min。
4.將上清移至一個(gè)干凈離心管中,加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉(PH5.2),混勻,再加5體積預(yù)冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃放置至少2小時(shí)。
5.5000g 0℃離心10分鐘沉淀核酸,棄上清液,室溫干燥。
6,每個(gè)提取RNA的組織或細(xì)胞樣品中,加入l0~15min鹽酸胍勻漿液Ⅱ,攪拌溶解。
7.加入2.5體積預(yù)冷的乙醇,立即充分混勻,-20℃至少放置2小時(shí)。
8.5000g 0℃離心10分鐘沉淀核酸,去上清,室溫?fù)]發(fā)乙醇。
9.按每克組織細(xì)胞加5min的比例.分兩次加入0.02mol/L EDTA(pH8.0) 先加1/2體積EDTA振蕩l~2分鐘,3000g離心2min.吸出上清.再加另一個(gè)1/2體積的.EDTA振蕩l一2分鐘.合并兩次核酸溶解液。.
10.用等體積氯仿—正丁醇(4:1)抽提核酸溶液,5000g室溫離心l0min,5000g室溫離心10min。吸出上清至另一個(gè)干凈離心管中。
11.加3倍體積lmol/L乙酸鈉 (PH7.0) 混勻,-20℃放置1h以上,此時(shí)RNA將選擇地沉淀,而DNA仍為溶解狀況。
12.5000g,0℃離心20min,沉于管底的是RNA。
13.吸去上清,用4℃預(yù)冷的lmol/L乙酸鈉(pH7.0)漂洗RNA沉淀。然后20℃ 5000g,離心20分鐘;厥誖NA。
14.盡量去除上清液。按每g組織細(xì)胞1m的比例加入RNA溶解液(0.2%SDS,0.5%mol/L EDTA,pH8.0)。注意:若有SDS沉淀析出.滴加0.11mol/L NaOH調(diào)溶液pH至7.5。
15.加入2倍體積冰預(yù)冷乙醇混勻,0℃放置至少2小時(shí),5000g,4℃離心10分鐘,RNA沉淀用70%乙醇漂洗,短暫離心后,棄上清,室溫干燥蒸發(fā)乙醇。
16.用適當(dāng)小容積DEPC處理過的ddH2O溶解RNA沉淀,加入3倍體積乙醇,
-70℃保存RNA備用。用時(shí).加入0.1體積的3mol/L乙酸鈉,混勻,12000g,4℃離心回收RNA。
三.試劑
1.鹽酸胍勻漿液Ⅰ
成分:8mol/L鹽酸胍(分子量為95.6),O.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),5mmol/L 2—巰基乙醇,0.5%十二烷基肌氨酸鈉
配制方法:取191g鹽酸胍.加8.35m1 3mol/L乙酸鈉(pH5.2)和6.25ml 0.2mol/L 2—琉基乙醇溶液中,再加水至237.5ml,混勻后加12.5ml 10%十二烷基肌氨酸鈉,振蕩混勻溶解。
2.鹽酸胍勻漿液Ⅱ
成分:8mol/L鹽酸胍(分子量力95.6),0.1mol/L乙酸鈉(pH5.2),1mmol/L 2
—琉基乙醇,20mmol/L EDTA(pH8.0)
配制方法:取191g鹽酸胍,加日.35ml 3mol/I。乙酸鈉(pH5.2)和1.25ml 0.2mol
/L 2—巰基乙醇溶液中,再加入10ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)。加水至250ml混勻。
3.乙醇
4.70%乙醇
5.氯仿—正丁醇(4:l,體積比)
6.4mol/L乙醇鈉,pH7.0
7.3mol/L乙醇鈉,pH5.2
8.RNA溶解液
成分:O.2%SDS.0.05mol/L EDTA, pH8.0
四、說明
提取RNA時(shí),要特別注意防止RNase的污染,所用玻璃器皿均應(yīng)用0.1%的二乙基焦碳酸鹽(diethyl pyrocarbonate,DEPC)處理。塑料器材均使用一次性用品,并高壓滅菌處理,必要時(shí),也可用0.1%DEPC處理。
篇二:真核細(xì)胞RNA的提取
RNA是基因表達(dá)產(chǎn)物,由以下幾類分子組成,rRNA(占細(xì)胞總RNA的80%~85%)、tRNA和核內(nèi)小分子RNA(占10~15%)、mRNA(占1~5%)。其中mRNA是分子生物學(xué)的主要研究對(duì)象,分離制備mRNA是克隆基因,分析基因表達(dá)以及建立cDNA文庫的首要步驟。
真核細(xì)胞總RNA分離提取的目的是要獲得高純度的具有充分長(zhǎng)度的`RNA分子,包括RNA的純度和完整性。RNA分離的關(guān)鍵是盡量減少RNA酶的污染。RNA酶活性非常穩(wěn)定,分布廣泛,除細(xì)胞內(nèi)源性的RNA酶外,環(huán)境中也存在RNA酶。因此在提取RNA時(shí),應(yīng)盡量創(chuàng)造一個(gè)無RNA酶的環(huán)境,包括去除外源性RNA酶的污染和抑制內(nèi)源性RNA酶活性。主要是采用RNA酶的阻抑蛋白R(shí)Nasin和強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑鹽酸胍或異硫氰酸胍抑制內(nèi)源性RNA酶,采用焦碳酸二乙酯(DEPC)去除外源性RNA酶。
一、RNA提取 的關(guān)鍵
真核細(xì)胞RNA的提取過程有四個(gè)關(guān)鍵點(diǎn),即①樣品(細(xì)胞或組織)的有效破碎;②有效地使核蛋白復(fù)合體變性;③對(duì)內(nèi)源RNA酶的有效抑制;④有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;其中最關(guān)鍵的是抑制RNA酶活性。提取的RNA可以用于核酸雜交、cDNA合成以及體外翻譯等。
二、組織RNA提取的基本步驟
1.儀器:勻漿器、低溫離心機(jī)、離心管。
2.試劑:氯仿、75%乙醇、異丙醇、DEPC溶液、1%甲醛變性膠、37%甲醛、3%過氧
化氫、甲酰胺、RNA上樣緩沖液。
3.主要步驟
。1)取組織50~100mg,加0.8ml Trizol沖洗勻漿器,移入同一離心管,冰上靜置5min。
氯仿,充分震蕩混勻,靜置
0.5ml異丙醇,顛倒混勻。-
1ml 75%乙醇溶液,漂洗沉
淀,
10min。
l DEPC溶液,充分溶解RNA
RNA溶解液,按一定比例稀釋后,紫外分光光度計(jì)測(cè)
值,計(jì)算OD260/OD280
OD260=1時(shí),RNA濃度約為
。絆D260×稀釋倍數(shù)×40
1%甲醛變性膠電泳觀察
甲醛變性凝膠板:4.5μl RNA,12000g×℃靜置2h,4℃1.7~2.0,根據(jù)下述公式計(jì)算×甲醛膠電泳緩沖液,離心。棄沉淀。 ×10min×5min離心。 :1之間,說明RNA濃度:3%過氧化3.5μl 37%甲(2)加0.2ml3min,4℃15min(3)取上清,加入204℃,12000g離心。 (4)棄上清,取沉淀,加入,7500g(5)棄上清,沉淀真空干燥(6)加40μ。 4.結(jié)果鑒定 (1)紫外分光光度計(jì)檢測(cè):取定260nm、280nmOD比值,如果比值在RNA純度可。 標(biāo)準(zhǔn)樣品當(dāng)40μg/mlRNA濃度(μg/ml。 (2)電泳檢測(cè):RNA質(zhì)量,電泳槽及制膠板先用氫浸泡過夜;制1%,2ul 5
醛,10ul甲酰胺,離心混勻,65℃變性15min后,迅速置冰浴中;再加入2μl RNA上樣緩沖液,離心混勻后上樣,6V/cm電壓,電泳1~2h;暗室內(nèi)紫外光下觀察,拍照;如果觀察到清晰的18S、28S RNA電泳帶,無大量小分子RNA,說明RNA無明顯降解,樣品-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>
三、注意事項(xiàng)
1、所有玻璃器皿160~180℃高溫干烤6h以上,非耐高溫器皿經(jīng)0.1% DEPC液浸泡后,經(jīng)高溫(15磅,20min)處理滅活RNA酶,所用試劑均用DEPC水配制,然后高壓處理。
2、實(shí)驗(yàn)用水要經(jīng)DEPC處理,但含Tris的試劑不能用DEPC處理。
3、實(shí)驗(yàn)操作過程中要戴一次性手套,以避免RNA酶污染。
藥大0942605
篇三:真核細(xì)胞rna提取
實(shí)驗(yàn)原理:
根據(jù)成熟雌蟾蜍體內(nèi)含大量卵細(xì)胞且可以方便獲取,細(xì)胞內(nèi)含核酸豐富,沒有其它組織器官等的干擾等優(yōu)點(diǎn)以確定蟾蜍卵細(xì)胞為實(shí)驗(yàn)所需的真核細(xì)胞。通過TRIZOL溶液中變性劑破碎真核細(xì)胞,然后經(jīng)過氯仿等有機(jī)溶劑抽提RNA,再利用RNA不溶于異丙醇的性質(zhì)將自身析出,達(dá)到分離提純的目的。
TRIzol的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。
甲基綠—吡羅紅為堿性染料,它分別能與細(xì)胞內(nèi)的DNA、RNA結(jié)合呈現(xiàn)不同顏色。當(dāng)甲基綠與吡羅紅作為混合染料時(shí),甲基綠與染色質(zhì)中DNA選擇性結(jié)合顯示綠色或藍(lán)色;吡羅紅與核仁、細(xì)胞質(zhì)中的RNA選擇性結(jié)合顯示紅色。其原因可能是兩種染料的混合染液中有競(jìng)爭(zhēng)作用,同時(shí)兩種核酸分子都是多聚體,而其聚合程度有所不同。甲基綠易與聚合程度高的.DNA結(jié)合呈現(xiàn)綠色。而吡羅紅則與聚合程度較低的RNA結(jié)合呈現(xiàn)紅色(但解聚的DNA也能和派洛寧結(jié)合呈現(xiàn)紅色)。即RNA對(duì)派洛寧親和力大,被染成紅色,而DNA對(duì)甲基綠親和力大,被染成綠色。09419
實(shí)驗(yàn)材料:
(一)試劑
1.甲基綠—吡羅紅染料:①染色劑A液的兩種配制方法
第一種方法:取吡羅紅甲基綠粉1g,加入到100mL蒸餾水中溶解,然后用濾紙過濾,將濾液放入棕色瓶中備用。
第二種方法:取甲基綠2g溶于98mL蒸餾水中,取吡羅紅G5g溶于95mL蒸餾水中。取6mL甲基綠溶液和2mL吡羅紅溶液加入到16mL蒸餾水中,即為A液,放入棕色瓶中備用。(注意:用于核酸染色的是吡羅紅G,請(qǐng)不要錯(cuò)買吡羅紅B。)
、谌旧珓〣液的配制方法B液是一種緩沖液,由乙酸鈉和乙酸混合而成。先取乙酸鈉16.4g,用蒸餾水溶解至1000mL備用;再取乙酸12mL,用蒸餾水稀釋至1000mL備用。取配好的乙酸鈉溶液30mL和稀釋的乙酸20mL,加蒸餾水50mL,配成pH為4.8的B液(緩沖液)。
、廴旧珓┑呐渲迫旧珓┦怯葾液、B液混合配制而成的。取A液20mL和B液80mL混合,就是實(shí)驗(yàn)中所用的吡羅紅甲基綠染色劑。應(yīng)該注意的是該試劑應(yīng)現(xiàn)配現(xiàn)用。
2.TRIZOL試劑(Invitrogen公司購買)
3.75%乙醇
4.氯仿
5.異丙醇
6.Nacl(0.14m/l)
。ǘ┢鞑
1.離心機(jī)(3000r.p.m)
2.冰浴
3.研缽
4.燒杯
5.量筒
6.試管
7.玻棒
8.膠頭滴管9
9.離心管
10.天平
實(shí)驗(yàn)方法:
制備勻漿:
以班級(jí)為單位,稱取大概10g蟾蜍卵細(xì)胞(2~3℃保存),于研缽(可置于冰浴鍋上)中,根據(jù)10~30mg組織細(xì)胞加1mltrizol試劑的量加入其中,快速研磨,制備勻漿。實(shí)驗(yàn)二人合作為一組,每組取大概10ml勻漿。
RNA的提。
取回勻漿后,室溫靜置10min,使樣品充分裂解——離心(3000r.p.s)20mins——取上清液移至新的離心管——加1/5TRIZOL溶液體積氯仿——在手中反復(fù)振蕩搖勻,室溫靜置10min。——離心20mins——取上清液——在上清中加入等體積冰冷的異丙醇,室溫放置10min!浞只靹,靜置10minute——離心20min——沉淀用75%乙醇洗滌兩次
定性試驗(yàn):
取2支干凈試管,一管加入1.5MLRNA溶液(將RNA顆粒狀的沉淀溶于
2ML0.14/NACL溶液中),另一管加入蒸餾水1.5ML,像兩管中加入3M甲基綠-吡羅紅染色劑,溶液變成紅色為陽性反應(yīng)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
利用TRIZOL法可成功提取的RNA,并使得甲基綠-吡羅紅染色劑顯紅色。
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
TRIzol對(duì)人體有害,使用時(shí)應(yīng)戴一次性手套,注意防止濺出。
由于本科生實(shí)驗(yàn)室里的為普通離心機(jī),轉(zhuǎn)速不高,故可適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。
離心后,注意上清液和沉淀的取舍以及對(duì)RNA層的小心吸取,否則將導(dǎo)致RNA樣品中有DNA污染。
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