α螺旋
蛋白質(zhì)分子中多個肽平面通過氨基酸a-碳原子的旋轉(zhuǎn),使多蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu) 肽主鏈各原子沿中心軸向右盤曲形成穩(wěn)定的α螺旋(a-helix)構(gòu)象。
α螺旋具有下列特征:
(1)多肽鏈以肽單元為基本單位,以Cα為旋轉(zhuǎn)點形成右手螺旋,氨基酸殘基的側(cè)鏈基團伸向螺旋的外側(cè)。
(2)每3.6個氨基酸旋轉(zhuǎn)一周,螺距為0.54nm,每個氨基酸殘基的高度為0.15nm,肽鍵平面與中心軸平行。
(3)氫鍵是α螺旋穩(wěn)定的主要次級鍵。相鄰螺旋之間形成鏈內(nèi)氫鍵,即每個肽單位N上的氫原子與第四個肽單位羰基上的氧原子生成氫鍵,氫鍵與中心軸平行。若氫鍵破壞,α螺旋構(gòu)象即被破壞。
α螺旋的形成和穩(wěn)定性受肽鏈中氨基酸殘基側(cè)鏈基團的形狀、大小及電荷等影響。如多肽中連續(xù)存在酸性或堿性氨基酸,由于帶同性電荷而相斥,阻止鏈內(nèi)氫鍵形成趨勢而不利于α螺旋的生成。